リフォーム会社とのトラブルについて教えて下さい

[匿名さん]

現在、リフォーム中なんですが、工事前に壁を切り、間仕切り（折れ戸）をつくることになっていましたが、
最近になり知り合いの別の設計士さんに図面を見てもらったところ、そこは構造上とってしまうと耐震性で問題あると言われてしまいました。
リフォーム会社は、その位大丈夫だ！と聞き入れません（言ってる本人は建築士ではない）
もう工事も始まってしまい大きく切るところを
仕方なくドア一枚分切るだけになってしまいました。（それも問題アリ）
もう、不信感で一杯ですが、まだ他の部屋のリフォームも残っており今、止めるわけにもいかず・・・
あちらは、全額払ってくれないと困ると言いますが、こちらとしては今後、訴訟も考えてます。

この場合、全額払うものなんでしょうか？？

小さなリフォーム会社なんで瑕疵など考えると、なんでこんな会社に頼んでしまったのかと！と後悔ばかりしてます。

どうしたらいいんでしょうか。。
建物に影響がでたら直してもらえるのでしょうか？