エアパスは基礎部と屋根部に開口部があり、開口部が開いているときは排熱を。閉めている状態なら集熱する工法です。こちらは四季の住まいの注文住宅がコレにあたります。エアパスグループというサイトの記事を下に載せておきます。
http://www.airpass.jp/airpass/mechanism02.html
夏の時は壁内部を自然換気することで断熱性能を上げようという発想です。ちなみに冬の時は換気口を閉めることで家の内部から発生する熱で壁内部の温度も温め、保温性を高くしています。
対して全館空調は34さんの言う通りの機能があります。ほかにもどこかに外付けで清浄機や除湿器加湿器を置くだけで全室に同様の効果が得られることでしょう（もっとも全室に空気循環する以上効果は微々たるものでしょうが。全館空調を採用されているメーカーの人に聞いてみた方がいいでしょう）
此方も実は四季の住まいのTOIROシリーズというプランがあり、全館空調、熱交換型システム換気を採用しています。
他社のHPですが、全館空調について詳しく書いているサイトを載せておきます
https://ienou.com/central-merit/

自分は家のど真ん中（リビングの上をステップフロアにした）に開口部を設けて、一階と二階の気温が循環できるような感じにしました。
一応各部屋にエアコンを設置していますが、今年の夏場はほぼ稼働しているのは二階の中央部の、開口部のあるところに設置したエアコン一台で家全体が結構な涼しさです。循環のためのサーキュレーターと扇風機は一日中動きっぱなしですけど＾＾；

イメージが付きにくいと思うので、四季の住まいの施工例に「畳リビングで好きな本を愉しむ家」というタイトルがありますので、そこの三枚目の畳リビングの上側を
見てください。天井部分が一段高くなって、その側面に開口部があります。我が家もこのやり方を参考にしました。
四季の住まい本社がある敷地にもモデルハウスがあるのですが、こちらも似た間取りになっているので、参考になるかと思います。
長文失礼しました。