マンション売却時の確定申告について

[購入経験者さん]

昨年、10月に居住用マンションを売却しました。
（2年半居住し、3298万で購入→3350万で売却）
今年の2月〜3月に確定申告が必要のようでしたが、
失念していました。
6月くらいに税務署から「確定申告が行われていない」との手紙が来ました。
失念していた旨を書き返信しましたが、
その後、連絡等はありません。
やはり期限を過ぎていても確定申告は必要なのでしょうか？
また、行わない場合どのようなデメリットがあるのでしょう？

ご存じの方が居られてたら、よろしくお願い致します。。